Linux f�rt�z�s HOGYAN
Ram Samudrala (me@ram.org)
v1.1, 2003 j�nius 17.
_________________________________________________________________
Hogyan k�sz�ts�nk nagy teljes�tm�ny� Linux f�rt�ket.
_________________________________________________________________
1. Bevezet�s
Ez a dokumentum le�rja hogyan k�sz�tettem el a [1]kutat�saimhoz
sz�ks�ges nagy teljes�tm�ny� Linux f�rt�ket.
Az al�bbi inform�ci�kat a saj�t felel�ss�gedre haszn�ld. Nem v�llalok
felel�seget semmilyen cselekedeted�rt, amelyet ezen HOGYAN
elolvas�s�ra alapozol. Eme HOGYAN legfrissebb v�ltozata megtal�lhat� a
[2]http://www.ram.org/computing/linux/linux_cluster.html honlapon.
Szemben m�s dokumentumokkal, melyek �ltal�ban besz�lnek arr�l hogyan
kell f�rt�ket k�sz�teni, ez egy specifikus le�r�s arr�l, hogy a mi
laborunk mik�nt k�sz�tette el azt. �gy nem csak a sz�m�t�si szempontok
r�szleteit, hanem az asztali sz�m�t�g�p, laptop, �s a szerver
�ltal�nos szempontjait is tartalmazza. A dokumentum f�leg bels�
haszn�latra k�sz�lt, de feltettem webre is, mivel sz�mos e-mail-t
kaptam amik ugyanezekr�l az inform�ci�kr�l �rdekl�dnek. Mostan�ban -
ahogy egy m�sik 64 csom�pontos f�rt�t tervezetem - azt tal�ltam, hogy
nincs inform�ci� arr�l, pontosan hogyan gy�jthetsz �ssze olyan
komponenseket amib�l Linux alatt megb�zhat�an m�k�d� csom�pontokat
hozhatsz l�tre. Olyan inform�ci� ami nem csak a csom�pontokkal
t�rt�n� sz�m�t�st, hanem azok sz�ks�gleteit is tartalmazza. Legink�bb
arra haszn�lhat� ez a HOGYAN, hogy bemutassa milyen t�pus� hardverek
m�k�dnek j�l Linux alatt �s milyenek nem.
2. Hardver
Ez a fejezet a hardver v�laszt�sommal foglalkozik. Az [3]ismert
hardver probl�m�k fejezetet lesz�m�tva feltettem, hogy minden t�nyleg
j�l m�k�dik.
A hardver telep�t�se egyszer�, a legt�bb r�szlet benne van a
k�zik�nyvben. Minden r�szben a hardverlista a megrendel�s sorrendj�ben
tal�lhat� (a leg�jabb a legels�).
2.1 Csom�pont hardverek
32 db g�p az al�bbi �ssze�ll�t�ssal rendelkezik:
* 2 XEON 2.4GHZ 533FSB CPU
* Supermicro X5DPR-1G2 alaplap
* 2 512MB PC2100 DDR REG ECC RAM
* 1 40GB SEA 7200 HD
* 1 120GB SEA 7200 HD
* Supermicro Slim 24X CDROM
* CSE-812 400 C/B 1U doboz
32 db g�p az al�bbi �ssze�ll�t�ssal rendelkezik:
* 2 AMD Palamino MP XP 2000+ 1.67 GHz CPU
* Asus A7M266-D w/LAN Dual DDR alaplap
* 2 Kingston 512mb PC2100 DDR-266MHz REG ECC RAM
* 1 41 GB Maxtor 7200rpm ATA100 HD
* 1 120 GB Maxtor 5400rpm ATA100 HD
* Asus CD-A520 52x CDROM
* 1.44mb floppy meghajt�
* ATI Expert 2000 Rage 128 32mb
* IN-WIN P4 300ATX Mid torony h�z
* Enermax P4-430ATX t�pegys�g
32 db g�p az al�bbi �ssze�ll�t�ssal rendelkezik:
* 2 AMD Palamino MP XP 1800+ 1.53 GHz CPU
* Tyan S2460 Dual Socket-A/MP alaplap
* Kingston 512mb PC2100 DDR-266MHz REG ECC RAM
* 1 20 GB Maxtor UDMA/100 7200rpm HD
* 1 120 GB Maxtor 5400rpm ATA100 HD
* Asus CD-A520 52x CDROM
* 1.44mb floppy meghajt�
* ATI Expert 98 8mb AGP monitorvez�rl�
* IN-WIN P4 300ATX Mid torony h�z
* Intel PCI PRO-100 10/100Mbps h�l�zati k�rtya
* Enermax P4-430ATX t�pegys�g
32 db g�p az al�bbi �ssze�ll�t�ssal rendelkezik:
* 2 Pentium III 1 GHz Intel CPU
* Supermicro 370 DLE Dual PIII-FCPGA alaplap
* 2 256 MB 168-pin PC133 Registered ECC Micron RAM
* 1 20 GB Maxtor ATA/66 5400 RPM HD
* 1 40 GB Maxtor UDMA/100 7200 RPM HD
* Asus CD-S500 50x CDROM
* 1.4 MB floppy meghajt�
* ATI Expert 98 8 MB PCI monitorvez�rl�
* IN-WIN P4 300ATX Mid torony h�z
2.2 Szerver hardver
1 db szerver k�ls� haszn�latra (inform�ci� terjeszt�s) az al�bbi
�ssze�ll�t�ssal rendelkezik:
* 2 AMD Palamino MP XP 2000+ 1.67 GHz CPU
* Asus A7M266-D w/LAN Dual DDR
* 4 Kingston 512mb PC2100 DDR-266MHz REG ECC RAM
* Asus CD-A520 52x CDROM
* 1 41 GB Maxtor 7200rpm ATA100 HD
* 6 120 GB Maxtor 5400rpm ATA100 HD
* 1.44mb floppy meghajt�
* ATI Expert 2000 Rage 128 32mb
* IN-WIN P4 300ATX Mid torony h�z
* Enermax P4-430ATX t�pegys�g
2.3 Asztali sz�m�t�g�p hardver
1 db asztali sz�m�t�g�p az al�bbi �ssze�ll�t�ssal rendelkezik:
* 2 AMD XP 2600 MP CPU
* MSI K7D Master-L DUAL MS-6501 alaplap
* 4 1024MB PC2100 DDR REG ECC RAM
* 1 40GB SEA 7200 Maxtor merevlemez
* 2 120GB SEA 7200 Maxtor merevlemez
* PIONEER DVR-AO5 IDE DVD-RW
* 1.44mb floppy drive
* ATI Expert 2000 Rage 128 32mb monitorvez�rl� k�rtya
* IN-WIN P4 300ATX Mid torony h�z
* Intel PCI PRO-100 10/100Mbps h�l�zati k�rtya
* 450W ENERMAX P4-430ATX t�pegys�g
* CREATIVE SB 128 5.1 PCI hangk�rtya
2 db asztali sz�m�t�g�p az al�bbi �ssze�ll�t�ssal rendelkezik:
* 2 AMD XP 2600 MP CPU
* MSI K7D Master-L DUAL MS-6501 alaplap
* 2 512MB PC2100 DDR REG ECC RAM
* 1 40GB SEA 7200 Maxtor merevlemez
* 2 120GB SEA 7200 Maxtor merevlemez
* MSI 52X24X52X CR52-A2 CD-RW
* 1.44mb floppy drive
* ATI Expert 2000 Rage 128 32mb monitorvez�rl� k�rtya
* IN-WIN P4 300ATX Mid torony h�z
* Intel PCI PRO-100 10/100Mbps h�l�zati k�rtya
* 450W ENERMAX P4-430ATX t�pegys�g
* CREATIVE SB 128 5.1 PCI hangk�rtya
1 db asztali sz�m�t�g�p az al�bbi �ssze�ll�t�ssal rendelkezik:
* 2 AMD Palamino MP XP 2000+ 1.67 GHz CPU
* Asus A7M266-D w/LAN Dual DDR
* 2 Kingston 512mb PC2100 DDR-266MHz REG ECC RAM
* Ricoh 32x12x10 CDRW/DVD Combo EIDE
* 1 41 GB Maxtor 7200rpm ATA100 HD
* 1 120 GB Maxtor 5400rpm ATA100 HD
* 1.44mb floppy meghajt�
* ATI Expert 2000 Rage 128 32mb
* IN-WIN P4 300ATX Mid torony h�z
* Intel PCI PRO-100 10/100Mbps h�l�zati k�rtya
* Enermax P4-430ATX t�pegys�g
1 db asztali sz�m�t�g�p az al�bbi �ssze�ll�t�ssal rendelkezik:
* 2 Intel Xeon 1.7 GHz 256K 400FS
* Supermicro P4DCE Dual Xeon alaplap
* 4 256mb RAMBUS 184-Pin 800 MHz RAM
* 2 120 GB Maxtor ATA/100 5400 RPM HD
* 1 60 GB Maxtor ATA/100 7200 RPM HD
* 52X Asus CD-A520 INT IDE CDROM
* 1.4 MB floppy meghajt�
* Leadtex 64 MB GF2 MX400 AGP
* Creative SB LIVE Value PCI 5.1
* Microsoft Natural billenty�zet
* Microsoft Intellimouse Explorer
* Supermicro SC760 nagy torony h�z, 400W-os t�pegys�ggel
2 db asztali sz�m�t�g�p az al�bbi �ssze�ll�t�ssal rendelkezik:
* 2 AMD K7 1.2g/266 MP Socket A CPU
* Tyan S2462NG Dual Socket A alaplap
* 4 256mb PC2100 REG ECC DDR-266Mhz
* 3 40 GB Maxtor UDMA/100 7200 RPM HD
* 50X Asus CD-A520 INT IDE CDROM
* 1.4 MB floppy meghajt�
* Chaintech Geforce2 MX200 32mg AGP
* Creative SB LIVE Value PCI
* Microsoft Natural billenyt�zet
* Microsoft Intellimouse Explorer
* nagy torony h�z, 300W-os t�pegys�ggel
2 db asztali sz�m�t�g�p az al�bbi �ssze�ll�t�ssal rendelkezik:
* 2 Pentium III 1 GHz Intel CPU
* Supermicro 370 DLE Dual PIII-FCPGA alaplap
* 4 256 MB 168-pin PC133 Registered ECC Micron RAM
* 3 40 GB Maxtor UDMA/100 7200 RPM HD
* Asus CD-S500 50x CDROM
* 1.4 MB floppy meghajt�
* Jaton Nvidia TNT2 32mb PCI
* Creative SB LIVE Value PCI
* Microsoft Natural billenty�zet
* Microsoft Intellimouse Explorer
* nagy torony h�z, 300W-os t�pegys�ggel
2 db asztali sz�m�t�g�p az al�bbi �ssze�ll�t�ssal rendelkezik:
* 2 Pentium III 1 GHz Intel CPU
* Supermicro 370 DLE Dual PIII-FCPGA alaplap
* 4 256 MB 168-pin PC133 Registered ECC Micron RAM
* 3 40 GB Maxtor UDMA/100 7200 RPM HD
* Mitsumi 8x/4x/32x CDRW
* 1.4 MB floppy meghajt�
* Jaton Nvidia TNT2 32mb PCI
* Creative SB LIVE Value PCI
* Microsoft Natural billenty�zet
* Microsoft Intellimouse Explorer
* nagy torony h�z, 300W-os t�pegys�ggel
2 db asztali sz�m�t�g�p az al�bbi �ssze�ll�t�ssal rendelkezik:
* 2 Pentium III 1 GHz Intel CPU
* Supermicro 370 DE6 Dual PIII-FCPGA alaplap
* 4 256 MB 168-pin PC133 Registered ECC Micron RAM
* 3 40 GB Maxtor UDMA/100 7200 RPM HD
* Ricoh 32x12x10 CDRW/DVD Combo EIDE
* Asus CD-A520 52x CDROM
* 1.4 MB floppy meghajt�
* Asus V7700 64mb GeForce2-GTS AGP monitorvez�rl� k�rtya
* Creative SB Live Platinum 5.1 hangk�rtya
* Microsoft Natural billenty�zet
* Microsoft Intellimouse Explorer
* nagy torony h�z, 300W-os t�pegys�ggel
3 db asztali sz�m�t�g�p az al�bbi �ssze�ll�t�ssal rendelkezik:
* 2 Pentium III 1 GHz Intel CPU
* Supermicro 370 DE6 Dual PIII-FCPGA alaplap
* 4 256 MB 168-pin PC133 Registered ECC Micron RAM
* 3 40 GB Maxtor UDMA/100 7200 RPM merevlemez
* Ricoh 32x12x10 CDRW/DVD Combo EIDE
* 1.4 MB floppy meghajt�
* Asus V7700 64mb GeForce2-GTS AGP monitorvez�rl� k�rtya
* Creative SB Live Platinum 5.1 hangk�rtya
* Microsoft Natural billenty�zet
* Microsoft Intellimouse Explorer
* nagy torony h�z, 300W-os t�pegys�ggel
2.4 T�zfal, �tj�r� hardver
1 db t�zfal az al�bbi �ssze�ll�t�ssal rendelkezik:
* AMD Palamino XP 1700+ 1.47GHz CPU
* MSI KT3 Ultra2 KT333 MS-6380E alaplap
* 512 MB PC2100 DDR-266MHz DIMM RAM
* 40GB Seagate 7200rpm ATA/100 merevlemez
* Asus 52X CD-A520 INT IDE cdrom
* 1.44 MB floppy meghajt�
* ATI Expert 2000 Rage 128 32mb monitorvez�rl� k�rtya
* 3 Intel Pro/1000T Gigabit Server ethernet k�rtya
* 4U Black Rackmount ac�l h�z
1 �tj�r� (gateway) az al�bbi �ssze�ll�t�ssal rendelkezik. Az �tj�r�
t�kr�z�se a t�zfalnak, arra az esetre, ha az �sszeomlana/elromlana.
* AMD Palamino XP 1800+ 1.57GHz CPU
* MSI KT3 Ultra2 KT333 MS-6380E alaplap
* 512 MB PC2100 DDR-266MHz DIMM RAM
* 40GB Seagate 7200rpm ATA/100 merevlemez
* Asus 52X CD-A520 INT IDE cdrom
* 1.44 MB floppy meghajt�
* ATI Expert 2000 Rage 128 32mb monitorvez�rl� k�rtya
* 3 Intel Pro/1000T Gigabit Server ethernet k�rtya
* 4U Black Rackmount ac�l h�z
2.5 Egy�b, kieg�sz�t� hardverek
Biztons�gi ment�s:
* 2 Sony 20/40 GB DSS4 SE LVD DAT drives
Monitorok:
* 2 17" Viewsonic VE700 LCD monitor
* 1 20.1" Viewsonic VP201M LCD monitor
* 1 22" Viewsonic P220F 0.25-0.27m monitor
* 4 21" Sony CPD-G500 .24mm monitor
* 2 18" Viewsonic VP181 LCD monitor
* 1 17" Viewsonic VE170 LCD monitor
* 2 Sun monitors
Nyomtat�k:
* HP colour laserject 4600dn
2.6 "K�ss�nk �ssze mindent egym�ssal" hardverek
KVM monitor kapcsol�kat haszn�lunk egy olcs� monitorral, hogy "l�ssuk"
az �sszes g�pet.
* 15" .28dp XLN CTL Monitor
* 3 Belkin Omniview 16-Port Pro Switches
* Belkin Omniview 2-Port Switch
* APC AR203 netshelter rack unit
Ez egy j� megold�s, de azt hiszem nem felt�tlen�l sz�ks�ges. Amire
sz�ks�g�nk van, az egy kis hordozhat� monitor amely a PC h�t�ra
csatlakoztathat� (stylus-al m�k�dik, mint a Palm). Nem tervezem t�bb
monitorkapcsol� illetve KVM k�belt haszn�lat�t.
A h�l�zat fontos:
* 2 Netgear FS750NA 48 port/1 git network switch
* 1 Netgear FSM750S 48 port/2 git network switch
* 1 Netgear FS517TS 16 port/1 git network switch
* 1 Netgear FS750NA 48 port network switch
* 1 Netgear FS524 24 port network switch
* 1 Cisco Catalyst 3448 XL Enterprise Edition 48 port network switch
* 1 Netgear ME102NA Wireless Access Point
* 1 Netgear MA401NA Wireless PCMCIA
2.7 K�lts�gek
A mi sz�ll�t�nk a Hard Drives Northwest ( [4]http://www.hdnw.com).
Minden sz�m�t�si csom�pont�rt a f�rt�nkben (a k�t processzort is
bele�rtve) k�r�lbel�l 1500-2000 USD-t fizett�nk ad�val egy�tt. Az
�ltal�nos c�lunk az volt, hogy a k�lts�g 1000 USD alatt legyen
processzoronk�nt (bele�rtve az egy�b alkatr�szek �r�t is).
3. Szoftver
3.1 Oper�ci�s rendszer: term�szetesen Linux!
Az al�bbi kerneleket �s disztrib�ci�kat haszn�ljuk:
* Kernel 2.2.16-22, KRUD 7.0 disztrib�ci�
* Kernel 2.4.9-7, KRUD 7.2 disztrib�ci�
* Kernel 2.4.18-10, KRUD 7.3 disztrib�ci�
* Kernel 2.4.20-13.9, KRUD 9.0 disztrib�ci�
Ezek a disztrib�ci�k j�l m�k�dnek mi�ta a friss�t�seket CD-n k�ldik
�s nem kell megb�zni a k�ls� h�l�zatban a friss�t�sek beszerz�s�hez.
"Tiszt�bbnak" t�nnek mint a szok�sos Red Hat disztrib�ci�k �s a
be�ll�t�sa nagyon stabil.
3.2 H�l�zati szoftver
A Shorewall 1.3.14a programot ( [5]http://www.shorewall.net)
haszn�ljuk t�zfalnak.
3.3 P�rhuzamos feldolgoz� szoftver
Mi a saj�t szoftver�nket haszn�ljuk alkalmaz�sok p�rhuzamos�t�s�ra, de
vannak tapasztalataink PVM-el �s MPI-al. Szerintem ezeknek az el�re
csomagolt programoknak az t�bbletterhel�se t�l nagy. Azt aj�nlom �rj�l
alkalmaz�s specifikus k�dot a feladatodhoz (mag�nv�lem�ny).
3.4 K�lts�gek
A Linux �s a legt�bb szoftver ami Linux rendszeren fut ingyen
m�solhat�.
4. Telep�t�s, be�ll�t�s �s �zemeltet�s
4.1 A merevlemez be�ll�t�sa
Ez a fejezet a merevlemez-part�cion�l�si strat�gi�t �rja le.
f�rt�z�tt g�pek:
hda1 - swap (2 * RAM)
hda2 - / (marad�k hely)
hdb1 - /maxa (teljes lemez)
asztali sz�m�t�g�p (windows n�lk�l):
hda1 - swap (2 * RAM)
hda2 - / (4 GB)
hda3 - /spare (marad�k hely)
hdb1 - /maxa (teljes lemez)
hdd1 - /maxb (teljes lemez)
asztali sz�m�t�g�p (windows-szal):
hda1 - /win (teljes disk)
hdb1 - swap (2 * RAM)
hdb2 - / (4 GB)
hdb3 - /spare (marad�k hely)
hdd1 - /maxa (teljes lemez)
laptop-ok (egy lemez):
hda1 - /win (a teljes lemezm�ret fele)
hda2 - swap (2 * RAM)
hda3 - / (marad�k hely)
4.2 Csomagok be�ll�t�sa
A f�rt g�peire a csomagok minim�lis halmaz�t telep�tett�k. A
felhaszn�l�knak megengedt�k, hogy �gy konfigur�lj�k az asztali
sz�m�t�g�peket, ahogy akarj�k.
4.3 Oper�ci�s rendszer telep�t�se �s karbantart�sa
Csomagok kl�noz�sa �s karbantart�sa
FAI
Az FAI ( [6]http://www.informatik.uni-koeln.de/fai/) egy automatiz�lt
rendszer, amely Debian GNU/Linux oper�ci�s rendszer telep�t�s�re
haszn�lhat� PC f�rt�k�n. Veszel egy vagy t�bb sz�z PC-t, bekapcsolod
�s n�h�ny perc m�lva a Linux fel van telep�tve �s be van �ll�tva,
futtat�sa az eg�sz f�rt�n semmilyen beavatkoz�st nem ig�nyel.
SystemImager
A SystemImager ( [7]http://systemimager.org) egy szoftver, ami
automatiz�lja a Linux �s szoftverek telep�t�s�t �s a termel�s
beind�t�s�t.
Egy�ni kl�noz�si strat�gia
Van egy teljesen elosztott rendszer�nk. Ezt azt jelenti, hogy minden
g�p az oper�ci�s rendszer egy p�ld�ny�t tartalmazza. Az oper�ci�s
rendszert minden g�pre manu�lisan telep�teni k�nyelmetlen. A telep�t�s
optimaliz�l�s�hoz el�sz�r egy g�pet telep�tettem �s �ll�tottam be
pontosan �gy, ahogy akartam. Azt�n k�sz�tettem egy t�m�r�tett tar
�llom�nyt az eg�sz rendszerr�l amit egy CD-ROM-on helyeztem el. V�g�l
err�l kl�noztam minden g�pet a f�rtben.
A tar �llom�ny k�sz�t�s�re az al�bbi utas�t�st haszn�ltam:
tar -czvlps --same-owner --atime-preserve -f /maxa/slash.tgz /
Egy go nev� szkriptet haszn�lok, ami veszi a hosztnevet �s az IP
c�met mint argumentumot, �s kicsomagolja a slash.tgz �llom�nyt a
CD-ROM-r�l, majd lecser�li a hosztnevet �s az IP c�met a megfelel�
helyeken. A go szkript �s bemeneti �llom�nyai el�rhet�ek a
[8]http://www.ram.org/computing/linux/linux/cluster/ c�men. Ezt a
szkriptet m�dos�tani kell a TE f�rt�d fel�p�t�sednek megfelel�en.
A Tom's Root Boot csomagot is haszn�lom ( [9]http://www.toms.net/rb/)
arra, hogy ind�tsam a g�pet �s kl�nozzam a rendszert. A go szkriptet
el lehet helyezni a CD-ROM-on vagy egy floppy lemezen ami a Tom's Root
Boot csomagot is tartalmazza. (t�r�lhetsz n�h�ny programot ebb�l a
csomagb�l, ha kifutsz a floppy lemez kapacit�s�b�l).
M�g k�nyelmesebb, ha k�sz�tesz egy ind�t� CD-ROM-ot ami a Tom's Root
Boot csomagot �s a go szkriptet, valamint a kl�nozni k�v�nt rendszer
tar �llom�ny�t tartalmazza. M�dos�thatod a Tom's Root Boot csomag
inicializ�l� szkriptj�t, hogy a go szkriptet futtassa (mindig be kell
majd �ll�tanod az IP c�met, ha nem haszn�lsz DHCP szolg�ltat�st).
Egy alternat�v lehet�s�g, hogy k�sz�tesz egy saj�t ind�t� lemezt
(mint egy ment� lemez), amely tetsz�sed szerinti kernelt �s
programokat tartalmaz. Sz�mos dokumentum l�tezik, ami le�rja ezek
k�sz�t�s�nek m�dj�t. A Linux Bootdisk HOWTO (
[10]http://www.linuxdoc.org/HOWTO/Bootdisk-HOWTO/) is tartalmaz
hivatkoz�sokat m�s el�re gy�rtott boot/root lemezekre.
�gy kifejleszthetsz egy rendszert ahol az �sszes dolog amit tenned
kell csak annyi, hogy behelyezed a CD-ROM-ot bekapcsolod a g�pet,
veszel egy cs�sze k�v�t (vagy s�tit) �s visszaj�ssz megn�zni a k�sz
kl�nt. Ezt az elj�r�st ism�telheted annyiszor, ah�ny g�ped van. Ez az
elj�r�s nagyon j�l m�k�dik nekem �s ha van valaki aki beteszi �s
kiveszi a CD-ROM-okat akkor m�g jobb.
Rob Fantini ( [11]rob@fantinibakery.com) m�dos�totta a fenti
szkriptet, Mandrake 8.2 rendszer kl�noz�s�hoz. Ez el�rhet� a
[12]http://www.ram.org/computing/linux/cluster/fantini_contribution.tg
z c�men.
Jelenleg egy olyan rendszeren dolgozok, amelyikben minden egy CD
lemezre van felrakva, err�l indul a g�p �s k�nnyen kl�nozhat�. A
k�zelj�v�ben k�zz�teszem a m�dszert.
DHCP vagy be�getett IP c�m?
Ha van egy m�k�d� DHCP szolg�ltat�sod, akkor nem sz�ks�ges �jra
be�ll�tanod az IP c�met �s ezt a r�szt t�r�lheted a go szkriptb�l.
A DHCP el�nye, hogy nem kell vacakolnod az IP c�mekkel mert a
megfelel�en be�ll�tott DHCP szerver szolg�ltatja azokat. Egy
h�tr�nya, hogy egy k�zponti szerveren van megval�s�tva (�s ahogy
mondtam azon vagyok hogy elosszam a dolgokat amennyire csak lehet). Az
IP c�mek hardver ethernet c�mekhez val� k�t�se is kellemetlen lehet,
amennyiben a g�pet vagy a hosztn�v cser�t a szok�sos m�don k�v�nod
v�grehajtani.
4.4 Ismert hardver probl�m�k
A hardverek �ltal�ban t�nyleg igaz�n j�l m�k�dtek. Specifikus
k�rd�seket az al�bbiakban sorolunk fel:
Az AMD dual 1.2 GHz g�pek igaz�n melegszenek m�k�d�s k�zben. Kett�
m�r �rezhet�en n�veli a szoba h�m�rs�klet�t. M�g j�k lehetnek
asztali sz�m�t�g�pekhez, de a h�t�s �s az energia fogyaszt�s
megfontoland�, amikor nagy f�rt�k r�szek�nt haszn�ljuk �ket. A
kor�bban bemutatott AMD Palmino konfigur�ci� igaz�n j�l m�k�dik, de
azt aj�nlom vegy�l k�t ventil�tort minden esetben, ez megoldotta az
�sszes instabilit�s probl�m�nkat.
4.5 Ismert szoftver probl�m�k
N�h�ny tar program nem �gy k�sz�ti el a tar �llom�nyt, ahogy azt
elv�rn�nk (k�l�n�sen a szimbolikus hivatkoz�sok visszafejt�s�ben
mutatkozik ez meg). A megold�s, hogy haszn�lj olyan tar programot, ami
j�l csin�lja, p�ld�ul a Red Hat 7.0 disztrib�ci�ban l�v�t.
5. Feladat v�grehajt�s a f�rt�n
Ez a fejezet �gy fejl�dik ahogy a f�rt�m haszn�lata alakul. Eddig
azon voltam, hogy meg�rjam a saj�t �zenet k�ld� elj�r�saimat,
amellyel k�l�nb�z� g�peken fut� processzek kommunik�lnak egym�ssal.
Sok alkalmaz�s - k�l�n�sen a sz�m�t�g�pes genomika ter�let�n -
massz�van �s k�nnyen p�rhuzamos�that�. Ez azt jelenti, hogy j�
eloszt�s �rhet� el az�ltal, hogy azonos feladatokat sz�runk sz�t a
g�pek k�z�tt (p�ld�ul amikor a teljes genomot analiz�ljuk azt a
technik�t haszn�ljuk, ami egy g�nen, proteinen dolgozik �s minden
processzor egy g�nen, proteinen dolgozhat id�ben, f�ggetlen�l a t�bbi
processzort�l).
Eddig nem kellet haszn�lunk profi queue rendszereket, de ez
nyilv�nval�an er�sen f�gg a futtatni k�v�nt alkalmaz�st�l.
5.1 Durva teljes�tm�nyteszt
Egyszer�en a legfontosabb programot futtattuk (a mi ab initio
protenin folding szimul�ci�s programunkat) egy Pentium 3 1GHz
processzoros g�pen referenci�nak. A k�vetkez� eredm�nyek sz�lettek:
Athlon 1.2 GHz processzor k�r�lbel�l 16% gyorsabb
Xeon 1.7 GHz processzor k�r�lbel�l 27% gyorsabb
Athlon 1.5 GHz processzor k�r�lbel�l 38% gyorsabb
Athlon 1.7 GHz processzor k�r�lbel�l 46% gyorsabb
Xeon 2.4 GHz processzor k�r�lbel�l 62% gyorsabb
Igen, az Athlon 1.5 GHz gyorsabb, mint a Xeon 1.7-es mivel a Xeon csak
hat utas�t�s per �rajelet (IPC), m�g az Athlon kilenc �rajelet futtat
(sz�molj!).
5.2 Folyamatos �zemid� (uptime)
A g�pek, mind hardver, mind szoftver tekintetben hihetetlen�l
stabilnak bizonyultak. Egyszer lettek debuggolva (rendszerint az �j
g�pek k�z�l n�h�ny hardver probl�m�val �rkezik) folyamatosan nagyon
nagy terhel�s alatt. Egy p�lda l�that� alul. �jraind�t�sok �ltal�ban
akkor t�rt�nnek, amikor elektromos zavar keletkezik.
2:29pm up 495 days, 1:04, 2 users, load average: 4.85, 7.15, 7.72
6. K�sz�netnyilv�n�t�s
A k�vetkez� szem�lyek seg�tettek ennek a HOGYANnak az elk�sz�t�s�ben:
* Michael Levitt ( [13]Michael Levitt)
7. Irodalomjegyz�k
Az al�bbi dokumentumok hasznosak lehetnek - ezek referenci�k olyan
forr�sokra, amelyek a nagy teljes�tm�ny� f�rt�k haszn�lat�val
foglalkoznak:
* [14]RAMBIN web page
* [15]RAMP web page
* [16]Ram Samudrala's research page (ebben a HOGYANban le�rt f�rttel
el�rt n�h�ny kutat�si eredm�nyt �r le)
8. Magyar ford�t�s
A magyar ford�t�st [17]Szalai Ferenc k�sz�tette (2003.05.19). A
lektor�l�st [18]Daczi L�szl� v�gezte el (2003.05.21). B�rmilyen
ford�t�ssal kapcsolatos �szrev�telt a [19]linuxhowto@sch.bme.hu c�mre
k�ldjetek. Eme dokumentum legfrissebb v�ltozata megtal�lhat� a
[20]Magyar Linux Dokument�ci�s Projekt honlapj�n. A ford�t�s jav�tva
2003.05.26.-�n.
References
1. http://compbio.washington.edu/
2. http://www.ram.org/computing/linux/linux_cluster.html
3. file://localhost/home/dacas/temp/Cluster-HOWTO-hu.html#known_hardware_issues
4. http://www.hdnw.com/
5. http://www.shorewall.net/
6. http://www.informatik.uni-koeln.de/fai/
7. http://systemimager.org/
8. http://www.ram.org/computing/linux/cluster/
9. http://www.toms.net/rb/
10. http://www.linuxdoc.org/HOWTO/Bootdisk-HOWTO/
11. mailto:rob@fantinibakery.com
12. http://www.ram.org/computing/linux/cluster/fantini_contribution.tgz
13. mailto:michael.levitt@stanford.edu
14. http://www.ram.org/computing/rambin/rambin.html
15. http://www.ram.org/computing/ramp/ramp.html
16. http://www.ram.org/research/research.html
17. mailto:szferi@angel.elte.hu_NO_SPAM
18. mailto:dacas@freemail.hu_NO_SPAM
19. mailto:linuxhowto@sch.bme.hu_NO_SPAM
20. http://tldp.fsf.hu/index.html